2Bの口から語らえる真実。人類はとっくに滅んでおり，アンドロイドが異星人と戦っているだけ。アンドロイドを鼓舞するため，YoRuHa部隊がいて，人類がいるふりをしている。人類が滅んでいることは秘密であり，秘密を知ったアンドロイドを殺すために2Bはいる。9Sは諜報部隊なので，それに気づくことが多く，2Bは何度も9Sを殺してはリセットしている。そしてアンドロイド部隊は全部ウィルスに感染され，2Bと9S以外は月基地も含め機械生命体に乗っ取られてしまったって話。
やっと，人類が滅んだということが明かされたか。人類は疫病で滅んだのね。てっきり月への移住自体がむりだったのでは？と思っていた。付きで何万の人類の生命維持とかコールドスリープとかじゃないと無理でしょ，と思っていたので。
2Bが9Sを殺した描写の意味もわかった。で，この後どうなるの？
一期の時，機械生命体にも人間のような心を持つものが現れて，9Sたちと交流を持っていたのが，今期は全然描かれてない。なにか絡んでくるんだろうか？
